Restriktionsenzyme

 
Zum Abbau der DNS schneiden sie die DNS-Stränge  an einer Stelle mit einer für jedes Restriktionsenzym typischen Abfolge von meist 4 bis 6 Nukleotiden auf. Diese Spaltstelle ist bei den meisten Restriktionsenzymen gleichzeitig die sogenannte Erkennungssequenz. 
Dabei entstehen überlappende Enden, die sich mit anderen Bruchstücken wieder verbinden können. (Klebrige Enden oder sticky ends)